Не силен в технических нюансах, но может дело было не в диске, а в самом маке? Не было устройства на другой ОС, чтобы проверить работоспособность диска напрямую?
Плюс, насколько я понимаю, AFP это устаревший протокол и корректней юзать SMB с галочкой для Time Machine. Но, вероятно, у вас свои причины для использования этого протокола.